在導熱油加熱器正常工作時，應保持導熱油十足的高速流動，謹防停泵停電，避免導熱油過熱結焦或積碳，過濾器應定期進行分選。 除此之外，還有一些導熱油加熱器需要注意的問題： 在停止加熱的同時，使導熱油溫度降到70度以下才能停止加熱油泵。突然斷電，應立即救火，然后按操作規程操作，否則也會使爐管燒壞，折價很大。按照導熱油加熱器的種類合理地選擇導熱油，杜絕超溫使用，絕對化得不到圖省省力的油，不要亂兌導熱油，否則后果很嚴重。為了防止導熱油氧化。
嚴格導熱油在50度以上時與空氣接觸，如使導熱油發生裂化，其速度驚人，且后果十分嚴重，應立即通知排氣管上的排氣閥關閉。在導熱油加熱器運行半年后，必須對導熱油進行檢驗取樣，發現問題，立即更換新的導熱油，但必須慎重，不能混入不同類型的導熱油。
在導熱油加熱器中嚴格控制導熱油的大循環流速不可小于1.5米/秒，因為操作部分將進出口溫度差拉得過大，使導熱油無法維持原有的循環往復狀態，邊界層變得更厚，熱阻變得更大，因而使爐壁跨越油膜的溫度升高，導致導熱油的積碳、裂解、攢動、結焦甚至燒穿爐管。
